1、二者承包范圍不同

建筑施工總承包資質能夠承接總承包工程，也能夠參與總承包資質范圍內的專業工程承包。獲得總承包工程的建筑企業還能夠能夠將工程的專業工程和勞務作業分包出去。
專業承包資質企業只能從事專業資質范圍內的工程承包和總工程承包企業發包的專業工程，可以把專業工程中的勞務作業分包出去。

2、二者資質等級不同

建筑施工總承包資質可以分為特級、一級、二級和三級四個等級，專業承包資質根據專業的不同，可以劃分為三個等級，也可以劃分為兩個等級。

3、二者資質增項不同

擁有建筑施工總承包資質的企業能夠增項序列內的其他類別資質，也能申請專業承包資質的增項。專業承包資質企業只能申請相近專業的資質增項，不能進行總承包資質的增項。

4、二者資質類別不同

在最新發布的建筑業企業資質中，總承包資質分為12個大類，專業承包資質分為60個專業。專業承包資質都是從大類中的總承包資質中劃分出來的，總承包資質涵蓋了專業承包資質的所有工程承包范圍。